Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp3Q91W36 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp3Q91W36 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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