Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Uhrf1Q8VDF2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Uhrf1Q8VDF2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Uhrf1Q8VDF2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Uhrf1Q8VDF2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Uhrf1Q8VDF2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Uhrf1Q8VDF2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Uhrf1Q8VDF2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Uhrf1Q8VDF2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Uhrf1Q8VDF2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Uhrf1Q8VDF2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Uhrf1Q8VDF2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Uhrf1Q8VDF2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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