Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q8VCE4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q8VCE4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms