Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Dnajc28Q8VCE1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dnajc28Q8VCE1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Dnajc28Q8VCE1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dnajc28Q8VCE1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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