Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Top1mtQ8R4U6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Top1mtQ8R4U6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Top1mtQ8R4U6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Top1mtQ8R4U6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Top1mtQ8R4U6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Top1mtQ8R4U6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Top1mtQ8R4U6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Top1mtQ8R4U6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Top1mtQ8R4U6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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