Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms