Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Casc3Q8K3W3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Casc3Q8K3W3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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