Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nsl1Q8K305 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms