Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scara5Q8K299 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms