Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Mtmr3Q8K296 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mtmr3Q8K296 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mtmr3Q8K296 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mtmr3Q8K296 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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