Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Trim68Q8K243 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim68Q8K243 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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