Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sde2Q8K1J5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms