Protein–RNA interactions for Protein: Q8K119

Pms1, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms1Q8K119 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pms1Q8K119 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pms1Q8K119 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pms1Q8K119 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pms1Q8K119 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pms1Q8K119 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pms1Q8K119 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pms1Q8K119 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pms1Q8K119 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pms1Q8K119 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Pms1Q8K119 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pms1Q8K119 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pms1Q8K119 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Pms1Q8K119 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pms1Q8K119 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pms1Q8K119 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pms1Q8K119 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pms1Q8K119 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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