Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Hpf1Q8CFE2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Hpf1Q8CFE2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hpf1Q8CFE2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hpf1Q8CFE2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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