Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Usp27Q8CEG8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Usp27Q8CEG8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Usp27Q8CEG8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Usp27Q8CEG8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Usp27Q8CEG8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Usp27Q8CEG8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Usp27Q8CEG8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Usp27Q8CEG8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Usp27Q8CEG8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms