Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup88Q8CEC0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup88Q8CEC0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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