Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CntrobQ8CB62 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CntrobQ8CB62 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms