Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc113Q8C5T8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms