Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Olfr452-201ENSMUST00000075468 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim35Q8C006 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim35Q8C006 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim35Q8C006 AV039307-201ENSMUST00000124795 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim35Q8C006 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim35Q8C006 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim35Q8C006 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms