Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vps13cQ8BX70 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vps13cQ8BX70 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vps13cQ8BX70 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Vps13cQ8BX70 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vps13cQ8BX70 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vps13cQ8BX70 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vps13cQ8BX70 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vps13cQ8BX70 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vps13cQ8BX70 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Vps13cQ8BX70 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Vps13cQ8BX70 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vps13cQ8BX70 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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