Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdcl3Q8BVF2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms