Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmod1Q8BVA4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms