Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnpy4Q8BQ47 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms