Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nop53Q8BK35 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nop53Q8BK35 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Nop53Q8BK35 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nop53Q8BK35 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nop53Q8BK35 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nop53Q8BK35 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nop53Q8BK35 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nop53Q8BK35 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nop53Q8BK35 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nop53Q8BK35 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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