Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ubash3bQ8BGG7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ubash3bQ8BGG7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ubash3bQ8BGG7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ubash3bQ8BGG7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ubash3bQ8BGG7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ubash3bQ8BGG7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms