Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Htatsf1Q8BGC0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms