Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf187Q8BFX1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf187Q8BFX1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf187Q8BFX1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf187Q8BFX1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf187Q8BFX1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf187Q8BFX1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf187Q8BFX1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf187Q8BFX1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf187Q8BFX1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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