Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Liat1Q810M6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms