Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim19Q80ZU4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim19Q80ZU4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms