Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc29Q80VM3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ttc29Q80VM3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ttc29Q80VM3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc29Q80VM3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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