Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccp110Q7TSH4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms