Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dsg1bQ7TSF1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms