Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shq1Q7TMX5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms