Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ubfd1Q78JW9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ubfd1Q78JW9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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