Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed3Q78IS1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms