Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nme8Q715T0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Nme8Q715T0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme8Q715T0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nme8Q715T0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nme8Q715T0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nme8Q715T0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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