Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpv1Q704Y3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trpv1Q704Y3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms