Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp8b3Q6UQ17 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp8b3Q6UQ17 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms