Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmeff1Q6PFE7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms