Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zbtb39Q6PDK0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zbtb39Q6PDK0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms