Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trak1Q6PD31 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms