Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
BC061212Q6P8K3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms