Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

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Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hdac10Q6P3E7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Hdac10Q6P3E7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdac10Q6P3E7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms