Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rcbtb1Q6NXM2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms