Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt40Q6IFX3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms