Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nop58Q6DFW4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nop58Q6DFW4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms