Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzrn3Q69ZS0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzrn3Q69ZS0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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