Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sh3rf1Q69ZI1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sh3rf1Q69ZI1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sh3rf1Q69ZI1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Sh3rf1Q69ZI1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sh3rf1Q69ZI1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sh3rf1Q69ZI1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3rf1Q69ZI1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Sh3rf1Q69ZI1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Sh3rf1Q69ZI1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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