Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atg9aQ68FE2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Atg9aQ68FE2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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Atg9aQ68FE2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atg9aQ68FE2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms