Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna3Q65CL1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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